Les querelles et dissensions fomentées par le Cointelpro au sein du Black Panther Party amplifie les divergences internes nées de l?affrontement entre le "ministre de la défense" qui est resté à Oakland, Huey Newton, et Eldridge Cleaver en exil à Alger. Certains des partisans de Cleaver fondent alors la Black Liberation Army (BLA) clandestine.
Fin 1971, le Black Panther Party se retrouve décimé par la répression, son audience diminue et ses dirigeants replient leurs actions sur leur base d'Oakland, en même temps qu'ils décident de réintégrer jeu politique "normal" en soutenant les candidats démocrates aux élections locales.
Les militants radicaux les plus chevronnés sont soit mort, soit en exil, soit en prison.
Un nouveau programme de contre-espionnage, "newkill", directement mis au point par Hoover et Nixon s?abattra sur les membres du BLA.
Le Cointelpro sera officiellement arrêté en 1971 après sa découverte fortuite par un groupe d?étudiants parti s?introduire dans un bureau du FBI.